墓圹挖好之后就是布置墓室了。地宫土圹底部约4000平方米的面积，也是经过精心规划布置的。
刘占成说，分区或分室是必然的，首先主室的位置要确定，主室要安排铜棺、石椁、黄肠题凑等，文献中还有“以水银为百川江河大海”的记载，其他一些放置陪葬品的副室或耳室也留有空间，供秦始皇地下享用。
一般的竖穴土圹墓都是用土填实的，但是秦始皇陵物探验证结果显示，地宫中存在石质板材。刘占成认为墓室中存在石质板材可能属于地宫墓室顶部的覆盖材料，即地宫应是券砌石顶。
“《史记·秦始皇本纪》中‘上具天文’的记载也就是说地宫顶部有绘制的天文星宿图;至于石材来源，则如晋人张华《博物志》所说‘取于渭(河)北诸山’。”刘占成说。
券顶之后则是墓顶封土，实际上这是地宫建造的最后一道工序。如今实测小山般的秦陵封土，其底部近似方形，南北长515米，东西宽485米，封土全部经过粗夯。
刘占成说：“高大的封土堆，象征着秦始皇帝的威严，标志着秦陵营建工程的基本结束。《史记·秦始皇本纪》：‘大事毕，已藏，闭中羡，下外羡门，尽闭工匠藏者，无复出者’，就是讲的地宫工程的结束情况。”
至于回填排水渠，则是想使秦陵地宫永久性地不被地下水侵蚀。刘占成认为，地宫工程一结束就会及时回填排水渠，排水渠底部应回填有很厚的青膏泥层，其上再用土夯实。
“如果我们用考古探铲钻探，打过夯土层，穿过青膏泥，必然会见到地下水，不过深度一定要打过30米才行。由于排水渠的回填密封，秦陵地宫内至今仍然没有地下水患也在情理之中。”他说。
秦陵地宫营建的每一个步骤都是重大的学术科题，都需要不断地深入研究。随着今后更细致的考古勘探与研究，结合物探等最新科技成果，秦始皇地宫的发掘也会到来。