针对玛雅文明的离奇消失之谜，后世学者们曾进行过深入的探讨和研究，并且还做出过以下几种合理的推测。首先，玛雅文明诞生于美洲的热带丛林中，生活的面积本身就不大，在该文明高速发展的过程中，人口数量也是在不断地增长着的。
当时的社会生产力是非常落后的，面对着极其沉重的人口负担，粮食出现短缺的问题，肯定是早晚都要面对的。丛林中根本就不适合农作物的生长，于是玛雅人就只好选择了迁徙，就此抛弃了繁荣的玛雅文明。
有一支科考团队在20世纪80年代的时候，曾深入了热带雨林中进行探索，他们耗费了长达六年的时间，在此期间内，对两百多处玛雅遗址进行过详细考察。
最终得到的结论是，玛雅部落之间会经常爆发激烈的战争，失败者的头颅会被拿去当成祭品，贵族之间也会为了争夺权力，而相互厮杀，这就直接导致人口的数量急剧减少，最终整个玛雅部落而面临覆灭。
即便是多么高度发达的文明，在面对疾病和瘟疫时，仍然会显得束手无策，曾经辉煌一时的玛雅文明就面临了这种生存考验。
瘟疫不仅会感染成年人，就连新生婴儿也是无法逃脱的，一场史无前例的瘟疫在人群中疯狂的蔓延起来，亲眼看着部落中的人大量死去，可却依旧无计可施。总的来说，以上猜测目前都是没有办法进行确切考证的，真相还需要不断地探索下去。