杂交水稻的成熟期有所不同。因为技术的限制，杂交水稻是很难留种的，常规水稻可以进行留种，一般情况下三年换一次种就可以了，杂交水稻种出来的水稻可能就会高低不同，甚至成熟期也会不同，也许这一株十天前就熟了，另一组需要十天后才能成熟，加大了农民的负担。所以对于农民来说，如果要种植杂交水稻，必须要去买专门的种子，而不是自行留种。与此同时，随着农业技术的发展，常规水稻的产量也在不断进步。
水稻亩产
现如今，常规水稻在高产的情况下可以实现亩产600公斤，而杂交水稻虽说亩产可以达到1500公斤以上，但这是实验室的数据。常规情况下，杂交水稻的亩产是1200公斤以上，是常规水稻的两倍，照理来说，两倍的数量也应该去种植杂交水稻了。可为什么种杂交水稻的人还是少呢？
水稻口感
这是因为杂交水稻跟常规水稻的定位不一样。有粮食专家曾经说，杂交水稻就是核武器和常规水稻，这是常规武器，在日常的使用中，我们还是主要以常规武器为主，但核武器我们也必须要有。杂交水稻的口感往往不如普通的常规水稻。还是那句话，很多人都已经解决了温饱问题，他们更多的是追求食物的品质，而杂交水稻的口感不如常规水稻，相对应的，超市里的常规大米价格往往要比杂交水稻高个好几倍。
转基因技术
农民们是很朴实的，他们觉得常规水稻好赚钱，自然而然的就会更推崇常规水稻。但值得一提的是，杂交水稻并不是转基因技术，这两种技术必须要做出区分。杂交是经过选育选择出来的，是将优质的条件相结合，就好像两个身体素质好的人结成了夫妻，生下一个更强壮的孩子一样。可转基因技术却并不是这样。现如今，转基因技术依旧存在大量争议，可杂交技术对人体是没有实质的损害的。